A ESEC oferece um conjunto de Mestrados (formação de 2º ciclo), que correspondem às necessidades de formação quer dos seus ex-alunos quer de profissionais que intervêm nos domínios específicos de formação da ESEC.
> Comunicação Social - Novos Media
> Comunicação Organizacional: Cidadania, Confiança e Responsabilidade Social
> Jogo e Motricidade na Infância
> Educação Especial
> Educação e Lazer
> Educação de Adultos e Desenvolvimento Local
> Ensino de Educação Musical no Ensino Básico
> Marketing e Comunicação
> Gerontologia Social NOVO!!
> Educação para a Saúde
> Turismo de Interior - Educação para a Sustentabilidade
> Human Computer Interaction
> Formação de Professores
- Educação Pré-Escolar
- Educação Pré-Escolar e Ensino do 1.º CEB
- Ensino do 1º CEB e de Português e História e Geografia de Portugal no 2º CEB
- Ensino do 1º CEB e de Matemática e Ciências Naturais no 2º CEB
> International Tourism For Development
> HCI – Human Computer Interaction
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